草菇数字基因表达谱揭示同核体与异核体CAZymes表达差异

草菇 (V. volvacea) 为草腐真菌，在热带和亚热带地区是一种重要的食用真菌。生产中，多以稻草或废棉等富含纤维素、半纤维素的材料为基质进行草菇栽培。草菇降解木质纤维素的能力是提高草菇在木质纤维素基质上的产值的主要限制因素。为了阐明草菇碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active Enzyme, CAZymes)家族与生物质降解潜力、同核体和异核体内CAZymes表达差异与生物学效率变化之间的关系，本研究基于Illunina/Solexa新一代测序技术，报道了草菇同核体与异核体的数字基因表达谱(3'-tag digital gene expression，DGE)。同时，在草菇基因组与转录组测序的支持下，通过高通量测序和生物信息学分析，研究了草菇基因组内CAZymes家族及纤维素酶、半纤维素酶和果胶酶子家族，并分析比较了其在草菇同核体与异核体内的差异表达情况。进一步探究了草菇同核体与异核体基因表达谱与核型之间的关系，以待解释CAZymes编码基因差异表达与同核体与异核体之间的关系，为深入理解草菇CAZymes家族和生物质降解机理奠定理论基础。本书适合普通高等院校生命科学类相关专业本科生、研究生和食用菌科研工作者使用。