有效siRNA的优化设计和软件开发及其快速筛选验证

RNAi是自然界普遍存在的导致目标mRNA降解的生物现象。从1998年发现以来，RNAi技术得到了飞速的发展，并已成为常规的基因沉默生物技术。RNAi的沉默效率和siRNA的序列设计有关。本研究广泛总结了前人研究中的优秀siRNA设计原则，并根据本研究小组的设计经验整合入自己特有的设计规则，应用FoxPro数据库编程语言开发了相应的siRNA设计系统，根据实际情况选择最合适的siRNA设计原则，使所设计的siRNA序列能够更有效地沉默目的基因的表达。同时，通过构建EGFP与目的基因融合的荧光报告系统，可快速通过荧光强度来评价siRNA的基因沉默能力，以期高通量快速地筛选出最佳的siRNA序列。