本著作基于2011年著者在西北农林科技大学完成的博士学位，在此感谢导师韦革宏教授给予的指导和帮助。本著作对新疆苦豆子不同组织部位的内生细菌进行了分离、纯化与保存，从苦豆子内生细菌中筛选了拮抗棉花枯萎病菌、棉花黄萎病菌的菌株，研究了拮抗棉花枯萎病菌和棉花黄萎病菌菌株的多样性及系统发育地位，对拮抗性菌株进行了盆栽控病实验及其拮抗机制研究，对抗MRSA菌株进行了筛选及其活性成分分析，得到以下主要结论： 1. 从新疆苦豆子不同组织部位中共分离获得内生细菌202株，不同组织部位分离获得的内生细菌菌株数存在明显的差异。 2. 202株苦豆子内生细菌对棉花枯萎病菌、棉花黄萎病菌均表现出一定的拮抗作用，其中125株对棉花枯萎病菌、棉花黄萎病菌的相对抑菌率均超过50％，48株内生细菌胞外分泌物对棉花枯萎病菌、棉花黄萎病菌有抑制作用。 3. 拮抗棉花枯、黄萎病菌的48株苦豆子内生细菌表型多样性丰富，在Waston距离为0.23时可聚为7个表观类群和12个独立成群的菌株。ERIC-PCR指纹图谱分析表明，在Watson距离为0.31时48株菌被划分为6个ERIC群和两个独立成群的菌株。两种分析方法结果基本一致。 4. 盆栽控病实验结果表明，5株拮抗性苦豆子内生细菌对棉花枯黄萎病都有较好的防效。 5. KDRE51可以通过产生活性化学物质、产生羧酸型铁载体、对棉花产生诱导系统抗性等多种方式对棉花枯萎病菌、棉花黄萎病菌进行拮抗。 6. KDRE51所产生的活性化合物ZSC－6对MRSA的抑菌圈直径达到22 mm，通过多种波谱技术最终将活性化合物ZSC－6鉴定为1-（5-氯-5-甲氧基正戊烷基）吡咯烷-2-酮。