链霉菌来源的卤化天然产物往往具有很好的生物活性和成药潜力，是新抗生素的重要来源。对典型生境来源的含卤化酶基因的链霉菌进行基因资源挖掘可望获得新的活性卤化天然产物。本文以3 株分别来自中国南海深海海泥、渤海浅海海泥及内陆贵州梵净山保护区土壤等环境样品的 Streptomyces olivaceus FXJ7.023 、 Streptomyces sp. FXJ7.388 和Streptomyces sp. FJS31-2 卤化酶基因阳性链霉菌为主要研究对象，通过次级代谢合成及修饰基因筛选Fosmid 基因组文库构建及筛选、基因组测序及其次级代谢基因簇预测分析，结合菌株发酵产物分离及结构解析、遗传操作、核糖体工程及培养条件优化等手段，在对这3株菌进行次级代谢潜力评估的基础上，对其次级代谢产物及其对应的生物合成基因簇进行挖掘和鉴定。