植物在生长发育过程中不断的受到各种微生物的影响。其为了在植物中生殖繁衍，采取多样的生命策略，其中最主要的是通过分泌效应因子以躲避或者破坏植物的防御系统。经过长期进化和自然选择，植物形成了一套抵御外界不利侵害的有效及精密的防御系统，并且这套系统随着病原物的进化而在不断变化。植物拥有先天免疫系统和后天免疫系统。植物先天免疫反应有两类，一类是由微生物相关分子模式如细菌的鞭毛蛋白等引发的免疫反应，也被称为基础免疫；另一类是由效应蛋白引发的免疫反应，也被称为抗病基因介导的抗性。植物的后天免疫反应包括系统获得性抗性和诱导获得性抗性。植物生长素通常被认为调节植物的生长和发育。研究发现病原会诱导水稻合成生长素，生长素信号传导激活延伸蛋白表达，引起细胞壁松弛而便于病原入侵。抗病QTL GH3-8编码生长素酰胺合成酶，通过催化形成生长素－氨基酸抑制生长素活性，从而保障细胞壁的致密性发挥基础抗病功能。这些研究回答了植物病理学界长期为之困惑的为什么植物生长素是致病因子的分子机理问题，同时也解释了植物在抗病反应中通常要付出生长被抑制代价的原因。研究揭示了维生素B1是抗病反应中的重要成分，应用维生素B1显著提高植物抗病性。发现抗病QTL OsDR8编码一个维生素B1合成酶，抑制其表达，减少水稻中维生素B1合成，使水稻易感白叶枯病和稻瘟病。