产业结构调整对于解决我国宏观经济结构性污染问题、缓解我国的环境资源压力和提升整体国民经济水平具有十分重要的意义。本文从数量环境经济分析的角度入手，在已有研究的基础上，结合区域宏观经济结构性问题和特点，提出了基于水资源有效利用的产业结构优化与调整方法。并以深圳市为案例深入研究了产业结构优化调整对其水资源可持续利用的作用和影响。 基于排污结构综合优化的行业污染物总量分配方法可以从环境管理的层面有效地推进当地产业结构的升级。行业经济结构、用水结构和排污结构的优化配置与其他环境保护措施的协同实施可以较好地缓解研究区的宏观经济结构性水污染和水资源浪费问题，为研究区域的可持续发展留下更多的发展空间。 基于水资源有效利用的产业结构优化与调整方法可以有效且可靠地给出地区行业经济结构、用水结构和产污结构的协同优化配置方案。优化预测方案所给出的行业结构变动趋势不仅符合经济发展的结构性变化规律，而且能较好地体现国民经济可持续发展的要求。