探索瘤胃真菌在反刍动物纤维饲料发酵过程中的相对贡献，对瘤胃微生物区系的研究意义重大。本试验旨在通过瘤胃真菌在不同底物瘤胃体外发酵过程相对贡献的初步研究，探讨瘤胃真菌与原虫的相互关系，为更深入的了解瘤胃真菌在纤维饲料瘤胃发酵过程中的作用提供依据。本试验采用最大可能数法计数瘤胃真菌,实时荧光PCR法检测瘤胃真菌和原虫数量，并对两种方法进行比较研究(试验一)；通过体外培养测定稻草，玉米秸秆，苜蓿和黑麦草的产气量及产气参数，挥发性脂肪酸(VFA)，采用实时荧光定量PCR法检测瘤胃真菌和原虫的数量(试验二)。试验一得出，实时定量PCR技术相比MPN法，不仅灵敏、可靠和省时，而且污染小。试验二得出，稻草、玉米秸秆、苜蓿和黑麦草的产气量分别降低了14.9％、14.0％、7.8％和11.2％；产气速率分别降低了9.9％、10.6％、5.0％和6.6％。稻草组的总VFA从培养前期到后期均呈现显著下降，玉米秸秆的总VFA浓度直到24h才显著降低，而12h虽有所下降但变化不显著。稻草和玉米秸秆的乙丙比均显著下降，苜蓿显著增加而黑麦草无明显变化。驱除真菌后随着培养时间延长，稻草组的原虫数量显著增加，而玉米秸秆显著减少。苜蓿和黑麦草组的原虫数量随着培养时间延长分别显著减少。以上结果提示，瘤胃真菌在劣质粗料(稻草和玉米秸秆)体外发酵中的相对贡献大于优质粗料(苜蓿和黑麦草）。