人类社会进入21世纪以来，科学技术的发展日新月异，全球一体化的浪潮更加汹涌澎湃。生产要素在全球范围内的快速流动，使得区域内的产业集群已经成为带动区域经济繁荣，促进产业结构升级的主要动力。如何有效地利用创新资源为区域产业集群发展服务，使其能够产生更大的经济效益和社会效益，已成为人们关注的焦点。近年来，在区域经济与管理的学术领域内，从区域创新和集群创新视角进行研究的理论成果颇为丰富，但将二者统一起来，系统地对区域集群式自主创新进行探讨的研究还不多见，在这一范畴还缺乏相应统一的理论指导。要加快创新进程，优化创新资源，提升区域产业集群创新能力，就必须对这类问题做出回答。基于以上目的，本文利用理论研究与实证研究相结合，定性研究与定量研究相结合的手段，采取了统计分析法、数学模型法、实证分析法等研究方法，探讨了区域集群式自主创新体系的结构、自主创新能力、合作机制以及区域集群式自主创新的政策 体系，并以安徽区域集群式创新现状为实证研究，力图为区域集群自主创新体系的构建和完善提供借鉴和参考。